Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms