Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCHP24723 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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