Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms