Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKACBP22694 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms