Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B1P20020 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms