Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms