Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSPP15924 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSPP15924 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSPP15924 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSPP15924 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSPP15924 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSPP15924 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DSPP15924 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSPP15924 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSPP15924 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSPP15924 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms