Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BMP3P12645 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BMP3P12645 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMP3P12645 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMP3P12645 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms