Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHRNB1P11230 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB1P11230 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms