Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL3P10147 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms