Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM225BP0DP42 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms