Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms