Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIGD3P0DMS9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms