Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA1P0DJI8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms