Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RD3LP0DJH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms