Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
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