Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLK3P07288 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLK3P07288 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLK3P07288 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLK3P07288 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLK3P07288 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLK3P07288 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLK3P07288 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLK3P07288 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms