Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTA1P02549 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms