Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HPRP00739 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HPRP00739 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HPRP00739 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HPRP00739 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPRP00739 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPRP00739 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPRP00739 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPRP00739 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPRP00739 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms