Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EGFRP00533 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EGFRP00533 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EGFRP00533 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EGFRP00533 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EGFRP00533 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EGFRP00533 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EGFRP00533 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EGFRP00533 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms