Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD3O95983 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD3O95983 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD3O95983 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms