Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP4K4O95819 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MAP4K4O95819 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MAP4K4O95819 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms