Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TIMM17BO60830 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms