Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPNO60542 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPNO60542 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPNO60542 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPNO60542 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSPNO60542 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPNO60542 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPNO60542 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPNO60542 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms