Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LY75O60449 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LY75O60449 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LY75O60449 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LY75O60449 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY75O60449 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY75O60449 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY75O60449 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LY75O60449 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LY75O60449 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LY75O60449 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LY75O60449 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms