Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms