Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRY3O43610 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRY3O43610 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms