Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSI1O43347 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSI1O43347 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSI1O43347 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MSI1O43347 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSI1O43347 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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