Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRTM2O43300 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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