Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms