Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FABP7O15540 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FABP7O15540 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FABP7O15540 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FABP7O15540 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FABP7O15540 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FABP7O15540 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FABP7O15540 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FABP7O15540 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FABP7O15540 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FABP7O15540 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms