Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF646O15015 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF646O15015 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms