Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F3O00716 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms