Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
J3KT08 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
J3KT08 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
J3KT08 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
J3KT08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms