Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KNCNA6PVL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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