Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC169A6NNP5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms