Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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