Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF9-201ENST00000415919 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF27-201ENST00000436041 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH5-201ENST00000341529 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HKR1-213ENST00000589392 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MATN2-213ENST00000522025 2731 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DPF3-216ENST00000614862 4221 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms