Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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