Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TAF1AQ15573 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 408 ms