Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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FOXQ1Q9C009 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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