Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTPRAP18433 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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PTPRAP18433 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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