Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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