Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GPNMB-202ENST00000381990 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TRHP20396 GLI1-208ENST00000546141 3475 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRHP20396 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TRHP20396 AEBP2-202ENST00000360995 2533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 GOLGA6A-201ENST00000290438 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 DPP9-203ENST00000594671 3851 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 SOX2-OT-213ENST00000492337 2508 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TRHP20396 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL137025.1-201ENST00000436932 2378 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL591222.1-201ENST00000568063 3844 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 LUCAT1-203ENST00000513626 2672 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 CLDN18-201ENST00000183605 3520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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