Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTF1Q16619 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms