Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BROX-207ENST00000537020 3670 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LRIT2-202ENST00000538192 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CYB561A3-221ENST00000546151 3986 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IMPDH1P10-201ENST00000440965 1542 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NOP14-AS1-207ENST00000515194 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF9-237ENST00000638021 3876 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-203ENST00000361569 2434 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MYL6B-211ENST00000553066 1305 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP8B5P-201ENST00000329395 2869 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF16-202ENST00000394909 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF596-202ENST00000320552 2696 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAGE1-206ENST00000502583 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CCL14-201ENST00000614009 3265 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms