Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC074043.1-201ENST00000483126 1776 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SOX9-AS1-217ENST00000623935 1563 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 STEAP3-AS1-201ENST00000454260 3218 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CCDC144B-201ENST00000285176 4310 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MAPK10-255ENST00000641020 2412 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ERVMER34-1-202ENST00000443173 3830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC02245-201ENST00000449259 2928 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OSBPL3-202ENST00000396429 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DHRS9-206ENST00000436483 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NVL-216ENST00000482491 3003 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR10G4-201ENST00000320891 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.7-201ENST00000392674 281 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC012354.2-201ENST00000423051 461 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SPAG11A-205ENST00000434307 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RN7SL448P-201ENST00000475566 295 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PAX8-211ENST00000497038 816 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ATP6V1G1P2-201ENST00000522436 346 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CR769775.3-201ENST00000610388 219 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR9Q1-202ENST00000612174 2134 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SLFN13-210ENST00000534689 3058 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ANO2-201ENST00000327087 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC012377.1-202ENST00000558675 4811 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NLRP4-201ENST00000301295 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZNF587P1-201ENST00000415378 1386 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 THBS3-211ENST00000541990 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AEBP2-202ENST00000360995 2533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PRYP4-201ENST00000306589 444 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms