Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL365356.3-201ENST00000427341 657 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPREP23469 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms