Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TTF2Q9UNY4 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms