Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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DUSP4Q13115 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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DUSP4Q13115 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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